הפנימייה הצבאית בחיפה נוסדה בשנת 1953, ביוזמתו של ראש הממשלה ושר הביטחון, דוד בן-גוריון. ארתור בירם, מנהל בית הספר הריאלי, הקים בחיפה את הפנימייה הראשונה, שנחנכה ב-22 באוקטובר 1953 על שמו ולזיכרו של אהרן בירם, בנו, בוגר ביה״ס הריאלי, שנהרג בעת מילוי תפקידו כטייס ב-1951. למפקד הפנימייה הראשון מונה סא"ל צבי צלנר, שעיצב את דפוסי פעילותה.
מפקדי הפנימייה לפי שנים:
1956-1953 צבי צלנר
1958-1957 שמואל אבי-עד
1960-1959 יהודה גביש
1965-1961 אליהו אורן
1966-1965 אלחנן אורן
1970-1966 מרדכי שי
1973-1970 אורי אלגום
1978-1973 עודד שחר
1980-1978 מוסק בן עמי
1982-1980 צביקה רק
1987-1982 שלמה אסיף
1989-1987 גיורא נווה
1998-1989 יחזקאל פנט
2010-1998 יפתח גיא
2017-2010 ליאור גרוס
2017-2020 ידידיה חזני
2020 – ערן מקוב